基幹講座 ＊は兼担教員 ＊＊は大学院担当
| 自然環境構造学分野 | 山室 真澄 教授 | 穴澤 活郎 准教授 | |
| 自然環境変動学分野 | 須貝 俊彦 教授 | ||
| 生物圏機能学分野 | 鈴木 牧 准教授 | 久保 麦野 准教授 | |
| 生物圏情報学分野 | 寺田 徹 准教授 | ||
| 自然環境評価学分野 | 奈良 一秀 教授 | 蘭光 健人 助教 | |
| 自然環境景観学分野 | 中村 和彦 講師 | ||
| 地球海洋環境学分野 | 小島 茂明 教授 | 芦 寿一郎 准教授 | |
| 海洋資源環境学分野 | 吉澤 晋 准教授 | ||
| 海洋生物圏環境学分野 | 北川 貴士 教授 | 板倉 光 助教 |
研究協力分野 ＊は兼担教員
| 地球環境モデリング学分野 | 今須 良一 教授 | 芳村 圭 教授＊ | CAUQUOIN, Alexandre 助教 |
| 環境情報学分野 | 小口 高 教授 | ||
| 海洋資源環境学分野 | 小松 幸生 准教授 | ||
| 海洋環境動態学分野 | 原田 尚美 教授 | ||
| 藤尾 伸三 准教授 | 田中 潔 准教授 | 川口 悠介 助教 | |
| 海洋物質循環学分野 | 小畑 元 教授＊ | 小川 浩史 教授 | 福田 秀樹 准教授 |
| 乙坂 重嘉 准教授 | 藤井 賢彦 教授 | 高畑 直人 助教 | |
| 海洋生物圏環境学分野 | 木村 伸吾 教授 | 山本 光夫 教授＊ | |
| 海洋生命環境学分野 | 佐藤 克文 教授＊ | 青山 潤 教授 | 井上 広滋 教授＊ |
| 峰岸 有紀 准教授 | 高木 悠花 准教授 | 脇谷量子郎 特任准教授 | |
| 平林 頌子 講師 | 矢萩 拓也 助教 | 大土 直哉 助教 |
国立環境研究所との連携講座
| 自然環境循環学 | 山本 裕史 教授 | 倉持 秀敏 教授 | 山岸 隆博 准教授 | 渡部 春奈 准教授 |
産業技術総合研究所との連携講座
| 地球表層地質環境学 | 田村 亨 教授 | 清家 弘治 准教授 | 水落 裕樹 准教授 |
